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AffinityNet:Semi-supervised Few-shot Learning for Disease Type Prediction——疾病预测的半监督小样本学习_亲和网络

来源:步遥情感网

骨架

堆叠 KNN attention pooling layers , 是 的泛化,首先不需要提前计算图,which is difficult for some kind of data(有没有graph都可以),其次不需要输入整幅图,将图分割有利于计算。

算法

1. feature attention layer

Graph Attention Model 在最初的特征使用线性变换,也就是仿射变化对原始特征进行了处理,从F‘不一定等于F可以看出来。
对于一个样本的特征向量,如果特征维度是F的话,就使用维度为F的一个特征注意力向量w来对特征进行处理 w = ( w 1 , w 2 , ⋯   , w F ) ∑ i = 1 F w i = 1 w = (w_1,w_2,\cdots,w_F) \quad \sum_{i=1}^{F}w_i=1 w=(w1,w2,,wF)i=1Fwi=1 h ~ i = w ⊗ h i \widetilde{h}_i = w \otimes h_i h i=whi即,每个元素相乘,因此该操作后特征维度不变,只是特征的影响能力会乘以一个权重,在总体流程图中以不同的颜色表示重要性。 【权重作用于特征

2. Attention kernel

实质: 计算样本之间的相似性促进池化,作用于feature attention之后。

3. kNN attention pooling layer

前面样本经过了特征注意力处理,然后对attention feature之后的样本进行attention 和normalized处理之后,整个过程如下: h ~ i ′ = f ( ∑ j ∈ N i a ( h ~ i , h ~ j ) ⋅ h ~ j ) \widetilde{h}'_i = f(\sum _{j \in N_i}a(\widetilde{h}_i ,\widetilde{h}_j)\cdot \widetilde{h}_j ) h i=f(jNia(h i,h j)h j)其中 h ~ i ′ \widetilde{h}'_i h i 表示池化输出, f f f表示池化函数,作用于attention 之后归一化的结点,确定该结点是否激活。例如 f ( h ) = m a x ( W h + b , 0 ) f(h)=max(Wh+b,0) f(h)=max(Wh+b,0)
[与GAM一样,括号内是一个结点新的输出,所以pooling layers 作用于结点,而不是特征,与之前的CNN等池化缩小feature map尺寸不一样]
如果给定了一个图可以直接来确定邻居节点。如果图较大,为了降低计算复杂度,随机选择K个样本用于计算。k是一个超参数。【我认为就是作者实现里面batch_size的大小,如果model 的设置里面k=None,那么k邻近就是batch_size的大小,如果k 有值,那么k邻近就是在batch_size里面选择k个样本】

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