男女双方户口不在一起可以通过以下方法办理结婚证：
1、准备材料：男女双方需要准备身份证、户口簿、未婚证明、结婚登记申请书等材料。
2、前往当地民政局：男女双方需要前往当地的民政局，提交结婚登记申请。在申请过程中，需要提供上述材料，并进行现场登记。
3、进行体检：在一些地区，男女双方需要进行婚前体检。体检可以在当地的卫生院或医院进行，需要提前预约。
4、领取结婚证：在申请审核通过之后，男女双方可以到民政局领取结婚证。通常情况下，领证需要缴纳一定的手续费。
办理结婚证需要的资料一般包括以下内容：
1、身份证件：男女双方需要提供有效的身份证件，例如身份证、护照等。
2、户口簿：男女双方需要提供有效的户口簿，证明自己符合结婚的相关条件。
3、婚姻状况证明：如果男女双方已经有过婚姻，需要提供离婚证书、丧偶证明等相关证明材料。
4、照片：男女双方需要提供各自的近期彩色照片。
5、其他材料：根据不同的地区和要求，申请人可能需要提供其他的证明材料，例如健康证明、结婚登记表等。
综上所述，不同地区的结婚登记规定可能略有不同，具体的办理流程和要求需要根据当地民政局的规定为准。建议男女双方在进行结婚登记前，提前咨询当地民政局的工作人员，了解具体的办理流程和要求，以便更好地进行申请。
【法律依据】：
《中华人民共和国民法典》第一千零四十六条
结婚应当男女双方完全自愿，禁止任何一方对另一方加以强迫，禁止任何组织或者个人加以干涉。
第一千零四十七条
结婚年龄，男不得早于二十二周岁，女不得早于二十周岁。
第一千零四十
直系血亲或者三代以内的旁系血亲禁止结婚。
第一千零四十九条
要求结婚的男女双方应当亲自到婚姻登记机关申请结婚登记。符合本法规定的，予以登记，发给结婚证。完成结婚登记，即确立婚姻关系。未办理结婚登记的，应当补办登记。
