非法经营罪案件退查了两次怎么办

需要作不起诉处理，对于二次补充侦查的案件，人民仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。

1、人民审查案件，可以要求机关提供法庭审判所必需的证据材料；认为可能存在法律上规定的以非法方法收集证据情形的，可以要求其对证据收集的合法性作出说明。

2、人民审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回机关补充侦查，也可以自行侦查。

3、对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民后，人民重新计算审查起诉期限。

4、对于二次补充侦查的案件，人民仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。

一、退侦补充侦查包括哪些种类？

(一)审查批捕阶段的补充侦查

人民对于机构提请批准逮捕的案件进行审查后，应当根据情况分别作出批准逮捕或者不批准逮捕的决定。对于批准逮捕的决定，机构应当立即执行，并且将执行情况通知人民。对于不批准逮捕的，人民应当说明理由，需要补充侦查的，应当同时通知机构。

(二)审查起诉阶段的补充侦查

1、补充侦查的形式。人民审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回机构补充侦查，也可以自行侦查。

2、补充侦查的期限和次数。对于补充侦查的案件，应当在1个月以内补充侦查完毕。补充侦查以两次为限。这既指退回机构补充侦查的案件，也包括人民自侦案件中决定退回补充侦查的案件。

3、经过一次补充侦查的案件，人民仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉决定。如果案件经过两次补充侦查，仍然证据不足，不符合起诉条件的，人民应当作出不起诉决定。

(三)法庭审理阶段的补充侦查

在法庭审判过程中，检察人员发现提起公诉的案件需要补充侦查，提出延期审理建议的，合议庭应当同意。人民应当自行侦查，必要时可以要求机构提供协助。