1、指单位体积中的细菌、霉菌、酵母等微生物的群落总数。也指1 mL水样在牛肉膏蛋白胨琼脂培养基中，于37 ℃培养24 h后所生长的腐生性细菌菌落总数。
2、在活菌培养计数中，由一个或多个生物体在固体培养基上生长繁殖形成的菌落称为菌落形成单位，表示活菌的数量。菌落形成单位的计数方法不同于一般的计数方法。一般直接在显微镜下计算菌体数量会将活与死的菌体全部算入，但是CFU只计算活的菌体数量。
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