福建师范大学闽南科技学院拥有丰富多样的专业选择，涵盖了工程技术、艺术设计、语言文学等多个领域。计算机科学与技术专业是学院的重点学科，网络工程专业则因其在省级特色专业和应用型专业群内的突出表现而备受关注。数字媒体艺术专业作为省级创新创业改革试点，致力于培养学生的创新能力和实践能力。通信工程、应用化学和光电信息科学与工程等专业也因其在省级创新创业改革试点和实践教育基地等方面的成就而闻名。
除了工程技术领域，学院还开设了多个语言类专业。英语、信息管理与信息系统和市场营销等专业都获得了省级特色项目的认可，体现了学院在语言和管理方面的深厚底蕴。汉语言文学专业则通过省级教学团队和专业综合改革试点项目，不断推动教学创新。
在艺术设计领域，信息工程和广告学专业作为省级服务产业特色专业，注重实践和创新，为学生提供了广阔的实践平台。食品科学与工程、环境科学和生物工程等专业，不仅在省级服务产业特色专业和应用型专业群内表现突出，还获得了省级特色专业的称号，体现了学院在这些领域的领先地位。
学院还提供了信息管理与信息系统、市场营销、工商管理、汉语言文学、广告学、服装与服饰设计、土木工程、工程造价、城市管理、智能科学与技术、国际经济与贸易等专业供学生选择。这些专业的设置，不仅满足了不同学生的兴趣和需求，也为他们提供了广阔的职业发展空间。
